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jeudi 28 août 2014

L'étude des rythmes biologiques

Pour ceux qui s'intéressent aux rythmes biologiques et surtout la découverte d'un rythme, je vous propose de tester quelques outils gratuits qui sont des compléments aux outils standards comme le Cosinor. Depuis l'existence de la chronobiologie et de ses applications cliniques, les chercheurs découvrent des pistes dans le domaine génétique avec le dernier composant chrono, mais on retrouve aussi beaucoup de choses pour l'origine des cancers ou l'évolution de la chronothérapie.  Ces troubles des rythmes biologiques seraient également responsables de maladies car une meilleure compréhension du vieillissement et des activités de travail révèlent une discontinuité fondamentale. Dans le domaine sportif, de nombreuses études ont permis de mettre en évidence l'importance de l'alimentation, les altérations de rythme du sommeil et la fréquence cardiaque. Pour aborder dans de bonnes conditions l’approche des rythmes biologiques, il est important de comprendre comment on découvre une période ou rythme à partir de mesures.

L’étude statistique d’analyse d’un phénomène périodique est complexe et la divergence des modèles utilisés dans plusieurs études ne permet pas de comparer les résultats. Il existe trois étapes essentielles pour mener à bien la recherche, la qualité de distributions des données, l’utilisation des analyses spectrales pour rechercher des périodes dans les données et tests de validation de la modélisation de la période.

Pour comprendre l'intérêt du programme Circwave, il suffit de regarder l'exemple ci-dessous que j'ai réalisé avec une prise journalière de la température corporelle sur 4 jours. L'ensemble des données se trouve sur deux colonnes avec les heures (H) et les mesures (T°). Il faut enregistrer votre  fichier sous format .csv pour être reconnu par le programme.
Circwave analyse les données indépendantes et transforme celles-ci en courbe de Fourier pour voir l'expression d'un rythme.
Les paramètres sont visibles pour la valeur F, la valeur du p, etc. Le calcul du profil s'inspire d'une régression harmonique linéaire à partir d'une fonction:






Je vous conseille de regarder les ressources sur Euroestech: systèmes scientifiques pour l'analyse des phénomènes rythmiques, l'analyse des séries chronologiques et de prévision. Vous trouverez des exemples de différentes séries expérimentales ou fictives. Sur une autre page, les publications, collaborations et activités du laboratoire. Vous trouverez également la page de téléchargement du logiciel du Time Series Analysis Cosinor 6.3.



Un grand merci à Benoît Mauvieux* pour la découverte des rythmes en chronobiologie. Vous pouvez lire un article intéressant sur le sujet : Etudes comparées des rythmes circadiens et reflet actimétrique du sommeil de sportifs et de sédentaires en poste régulier de nuit, par Benoît Mauvieux, Bruno Sesboüe, et Damien Davenne.
Une autre ressource pour les ostéopathes, "Chronobiologie et ostéopathie", mémoire en 1996 réalisé par Mr Laurent Moreau, Maître de mémoire G. de Coux.


*Thèse de Benoit Mauvieux, Dr de l'Université de Caen, le 3 Décembre 2004. Titre: Effets d'un entrainement physique et sportif régulier, chronique ou temporaire, sur les rythmes biologiques du travailleur de nuit.


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